بعد از درخشش باقری در هفتههای آخر لیگ این طور به نظر میرسید که منصوریان متقاعد شده او را نگه دارد که البته همین طور هم بود. اما منصوریان فقط یک طرف ماجراست. طرف دیگر ماجرا باقری است که گویا تصمیمش را برای جدایی از استقلال گرفته. اگرچه این موضوع را خود باقری هم تکذیب کرده اما شادی نکردن او بعد از گل اخیرش به سپاهان و پاس گلی که در بازی با التعاون به کاوه رضایی داد مشخص کرد که دلخوریاش از استقلال و منصوریان بیشتر از این حرفهاست. ضمن اینکه استقلال به شدت به دنبال تمدید قرارداد با هافبکهایش (همه به جز باقری) است و این نکتهای است که از چشم فرشید دور نمانده است.
از طرفی احتیاج مبرم پرسپولیس به یک هافبک دفاعی و اعلام نیاز برانکو به باقری باعث شده که این بازیکن تردیدی برای پیوستن به پرسپولیس نداشته باشد. او خودش هم در آخرین مصاحبهاش گفته بود باید سنگهایش را با منصوریان وا بکند چون میخواهد بیشتر بازی کند.